En 2006, Tom Fassaert termine ses études à l’Académie Hollandaise du Film avec le court-métrage Doel Leeft, un film autour d’un petit village flamand qui est menacé de démolition pour permettre l’agrandissement du port d’Anvers. Sélectionné pour le Prix Tusckinsky au festival du Film Hollandais, il a également reçu une mention du jury au festival International DOK, de Leipzig.
Tom Fassaert a ensuite réalisé plusieurs courts documentaires, dont L’Homme et la forêt, tout en travaillant au développement d’un scénario pour un long-métrage documentaire : Les Enfants du soleil.
En parallèle, il est resté en lien avec les derniers résidents de Doel, et décidé de continuer l’histoire qu’il avait commencé avec son film de fin d’études.
En 2011, après cinq ans de tournage et de montage, il termine son premier long-métrage documentaire : L’Ange de Doel (De Engel van Doel). La première mondiale de ce film a lieu au festival international de Berlin où il reçoit une mention honorifique du jury. Suite à la Berlinale, le film a été projeté dans plus de quarante festivals dans le monde entier et a reçu de nombreux prix.
Son dernier long métrage, A Family Affair, a été sélectionné et primé dans de nombreux festivals internationaux. Tom Fassaert a reçu pour ce film le Golden Caft (Gouden Kalf) du meilleur long-métrage documentaire en 2016.